【国土资源】 全市土地总面积110.16万公顷。其中林业用地面积70.34万公顷，占土地总面积63.9%；有林地面积64.70万公顷，占林业用地面积的91.9%；耕地面积240.1万亩，占土地总面积14.24%；园地面积129.3万亩，占土地总面积7.67%；林地面积789.5万亩，占土地总面积46.81%；牧草地0.9万亩，占土地总面积0.05%；其它农用地面积88.7万亩，占土地总面积5.26%；居民点及工矿用地面积161.3万亩，占土地总面积9.56%；交通用地12.5万亩，占土地总面积0.74%；水利设施用地面积11.2万亩，占土地总面积0.66%；未利用土地面积253.1万亩，占土地总面积15.01%；人均耕地为0.33亩。
【矿产资源】 全市已发现各类矿产46种，包括铁、锰、钒、钛、铜、铅、锌、银、钨、锡、钼、铋、金、稀土、硫铁矿、泥炭、水泥用灰岩、水泥用大理岩、叶腊石、伊利石、明矾、萤石（普通）、水晶、石墨、钾长石、高岭土、瓷石、水泥用粘土、耐火用粘土、砖瓦用粘土、紫砂土、建筑及饰面用花岗岩（凝灰岩、闪长岩）、饰面及雕刻用辉绿岩、冶金用脉石英、玻璃用石英岩、玻璃砂、型砂、建筑用砂、硅灰石、绢云母、彩石、绿柱石、硬高铝矿物、地热、矿泉水等，已发现矿种数占全省的38.98%。经过地质探明还有资源储量（包括尚未上储表）的22种，其中金属矿有铁、锰、铅、锌、钼、金6种；能源矿有煤、地热2种；非金属矿有玻璃（铸型）用砂、叶腊石、高岭土（瓷土、瓷石）、水泥用灰岩（大理岩）、饰面（雕刻）用石材等14种。现已探明矿产地有611处，其中大型矿床（井）14处、中型13处、小型152处。
【海洋资源】 全市海域面积1.13 万平方公里，略大于陆地面积。海域10～40米等深线面积1499平方公里，40～60米等深线面积1681平方公里。泉州海域蕴藏有丰富的生物、矿产资源。主要水产生物有500多种，其中鱼类115种、虾类10多种、贝类20多种。泉州浅海滩涂面积118万亩，盛产牡砺、蛏、螺、海带、紫菜等贝、藻类200多种。海砂、花岗岩、高岭土等滨海非金属矿产蕴藏量达26亿吨以上，潜在经济价值550亿元。
海岸线长427公里，大部分为基岩海岸，岸线婉蜒曲折，沿岸有湄洲湾、大港湾、泉州湾、深沪湾、围头湾和众多小港湾。沿海岛屿208个，岛屿岸线72公里。有适宜建港岸线44.7公里，其中中、深水岸线 42.l公里，已开发肖厝、后渚等16个港区，拥有大型深水泊位8个，中型泊位19个，小型泊位20多个，2003年港口货运吞吐量达2511万吨；有近海渔场50.6万公顷，国家中心渔港1个（深沪）、一级渔港2个（祥芝、崇武）、二级渔港4个、三级渔港8个；滨海旅游资源有崇武听涛、洛阳潮声、深沪海韵、黄金海岸等名列泉州十八景的旅游景点。
【水资源】 全市常年雨量充沛，境内溪流多达34条，总长1 620公里，水资源相当丰富。地表水总量87.6亿立方米，其中可利用的约14.56 亿立方米，平均产水量101.86亿立方米，水电蕴藏量达43万千瓦。晋江为泉州市第一大河，发源于戴云山东南麓，流经永春、安溪、南安、鲤城、晋江注入泉州湾，水系河流全长404.8公里，流域面积5629平方公里。大漳溪发源于德化县戴云山脉，全长234公里，流域面积4834平方公里，流经永泰注入闽江。洛阳江发源于城区北部朴鼎山南麓，全长40公里，流域面积230平方公里，经马甲、河市流入泉州湾。安溪县祥华溪、福前溪等5条溪流流入九龙江，黄塘溪等5条江河直接入海。此外，泉州地下水资源有10亿立方米，可利用的地下水0.76亿立方米。
【林业资源】 全市森林覆盖率达到58.7%，活立木蓄积量1921.53万立方米，其中，林分蓄积量1863.04万立方米，疏林地蓄积2.96万立方米，散生木和四旁树55.99万立方米，毛竹立竹量5649.1万根。在林分蓄积量中，杉木（含珍贵针叶树）蓄积量378.4万立方米，占林分蓄量的20.3%；马尾松1026.74万立方米，占55.1%；阔叶树（含珍稀阔叶树、硬阔、软阔、桉树）421.78万立方米，占22.6%；木麻黄36万立方米，占2.0%。全市生态公益林面积 26.3万公顷，占有林地面积的40.7%；商品林38.35万公顷，占59.3%。已区划界定的重点生态公益林27.9万公顷，占全市林地面积的39.7%。规模以上新造速生林面积 2.95万亩，投入资金1037.4万元。非公有制造林面积达 3.86万亩，占造林总面积的42.9%；新增竹林面积3975亩；经济林面积7756亩。
【野生动物资源】 全市两栖类、爬行类、鸟类、哺乳类野生动物资源有30目85科385种，分别为两栖类2目7科32种；爬行类3目13科61种；鸟类19目51科260种；兽类6目14科32种。全市有国家Ⅰ级重点保护野生动物鼋、蟒蛇、黑鹳、黄腹角雉、云豹、华南虎、金斑喙凤蝶、中华白海豚、中华鲟、红珊瑚等11种；有国家Ⅱ级重点保护野生动物虎纹蛙、黄嘴白鹭、鸳鸯、鸢、鹰雕、蛇雕、花田鸡、穿山甲、豺、黑熊、苏门羚等57种；有省重点保护野生动物39种；有列入《濒危野生动物种国际贸易公约》野生动物59种。泉州市野生动物资源种类在全省属于较为丰富地区。但是，许多珍稀物种仍然较为罕见，有的几乎没有踪迹，资源的脆弱性较明显，急需有针对性地加以保护。
【野生植物资源】 全市森林植物种类达174科，599属，1127种（或变种），主要包括亚热带雨林，常绿阔叶林，次生植被等。亚热带雨林有上层优质树种如红栲、米楮、黄杞、阿丁枫、红豆树等树种；常绿阔叶林有栲树、丁枫、黄杞、樟树、楠木等。次生植被以马尾松、木荷、枫香等树种为主；山顶常绿矮林为主，上层优质树种以台海松为主；海岸植被以秋茄、白骨址为主。
【自然保护区】 永春牛姆林自然保护区有国家重点保护二、三类珍稀动物、珍稀树种和名贵药材，如穿山甲、灵猫、观光木、水松、金钱莲等，拥有较为完好的亚热带常绿阔叶林。德化戴云山保护区因地形复杂、气象万千，植被茂密，动植物资源丰富，保持有原始和半原始状态的常绿阔叶林。全市建成国家级自然保护区、风景名胜区、森林公园各1个；省级自然保护区4个，风景名胜区2个，森林公园9个，自然保护区面积达5.03万公顷，自然保护区覆盖率4.63%。
【海洋自然保护区建设】 深沪湾国家级海底古森林遗迹自然保护区以保护海底古树桩遗迹、古牡蛎礁为主要对象。2003年保护区内建成污水处理设施，减少污染物排海，改善了保护区内海域水质；保护区科技大楼投入使用，提高了保护区科研、教育、展览的能力。
泉州湾河口湿地自然保护区以保护湿地生态系统、红树林及其栖息的野生动物为主要对象，区内常出现中华白海豚、中华鲟等国家一级保护动物，有二级保护动物24种。该保护区于2003年10月经省人民政府批准为省级自然保护区，其《总体规划》己进行初步论证。
