台湾自古是中国不可分割的神圣领土，这颗镶嵌在祖国东南的海上明珠，犹如中国南大门的一道屏障，历来为外强所觊觎。泉州与台湾唇齿相依，一次又一次在台湾历史发展的重要关头，显示出两地人民休戚与共的骨肉深情。
万历三十年（1602），倭寇窜入台湾剽掠，驻晋江石湖的浯屿水寨主帅沈有容率部渡海掩袭敌巢，"破倭奴东海上，海水尽赤"，从此，"海上息肩十年"。1604年，又有荷兰海军入侵澎湖，沈有容单舟驶澎湖，兵不刃血，斥退荷夷。1661年，荷兰人占据台湾38年后，泉台儿女再创伟业，郑成功率闽粤子弟兵在台湾人民全力支持下，经10个月苦战，驱逐侵略者，收复了故土。继郑成功收复台湾二十二年后，清朝政权鼎定，又是泉州人施琅挥师东渡，结束两岸分治对峙的局面。更由于施琅在完成军事行动后，不仅迅速稳定台湾社会，而且针对清廷一些议政大臣提出因台湾险远，要"迁其人、弃其地"的主张，六次上书，披肝沥胆，痛切陈词，上表著名的《恭陈台湾弃留疏》，指明台湾经济上有无限前途、军事上极其重要的战略地位，"弃之必酿成大祸，留之诚永固边隅"。施琅的见识以及对解决台湾问题的发言权，很大程度上影响了清廷做出明智的决策，使台湾成为清朝的一个行政区。从而揭开了台湾历史崭新一页。
历史上的泉州人入台，推动了台湾开发建设的迅速发展。而台湾的社会经济发展也促进了泉州的各项建设。明代中叶，泉台之间已逐步形成晋江安平至台南等航线，其后的清朝及近代，两地经济来往高潮迭起，泉州运台货物主要是药材、陶瓷、茶叶、纺织品、日用工艺品等；台湾运泉州的货物主要是大米、砂糖、鹿皮、鹿脯、水果及楠木、樟脑等。特别是台米运泉，一时为接济泉州缺粮的重要来源。清代泉州"稻米菽麦，今皆取给台湾"。台湾初创时，泉州人传入削樟取脑方法，发展了台湾的樟脑生产，而台湾则以生产的大批樟脑运销泉州。台湾盛产甘蔗，泉州人在清中期引入德国机器，改进生产方法，促进了台湾制糖业发展；又从台湾引进优良蔗苗，开始机器制糖，提高泉州的制糖业产量和品质。此外，台湾的藤器、大甲席等竹草编织品在泉州也颇有影响。
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